7月11日，中纪委网站通报：十二届全国人大教育科学文化卫生委员会副主任委员王三运涉嫌严重违纪，目前正接受组织审查。
之后，王三运被责令辞去第十二届全国人民代表大会代表职务。7月28日，甘肃省第十二届人大常委会第三十四次会议决定，接受其辞职。
9月1日，全国人民代表大会常务委员会发布公告，王三运的第十二届全国人民代表大会代表资格终止，其第十二届全国人民代表大会教育科学文化卫生委员会副主任委员职务也相应终止。
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